Un projet de création d'un réseau paneuropéen de ressources microbiologiques est lancé

Une nouvelle initiative européenne est en marche. Son but : la création d’un réseau paneuropéen de centres spécialisés dans la collecte, l’identification et la conservation des ressources microbiologiques (bactéries, virus, champignons, levures). Baptisé EMbaRC (European Consortium of Microbial Resource Centres), le projet triennal, lancé le 18 mars dernier, est financé à hauteur de 4,2 millions d’euros par l’Europe, pour un coût total estimé à 5,5 millions. EMbaRC rassemble dix organisations européennes de recherche de sept pays membres (dont l’Inra et l’Institut Pasteur en France). Ensemble, elles hébergent près de deux cent mille souches microbiologiques, ainsi que les souches de bactéries les plus anciennes, isolées en 1892. Ces institutions ont décidé de collaborer étroitement, d’une part pour harmoniser leurs techniques de conservation des microorganismes, d’autre part pour standardiser et faire évoluer leurs méthodes d’identification.

Mettre en place des banques d’ADN et évaluer les méthodes de stockage

Il s’agit également de mettre en place des banques d’ADN, qui intéressent de plus en plus la communauté scientifique (recherche, enseignement, industrie agro-alimentaire ou pharmaceutique, milieu hospitalier, etc.). Dans ce domaine, différentes méthodes de stockage de l’ADN existent, qu’il faudra évaluer et comparer. Parallèlement à ces chantiers, les centres de recherche souhaitent mettre en place un guide commun de biosécurité. « Contribuer à la pérennité des collections et à leur financement durable est l’une des missions prioritaires d’EMbaRC », explique Sylvie Lortal, directrice du Centre international de ressources microbiologiques-Bactéries d’intérêt alimentaire (Cirm-BIA) à l’Inra de Rennes. Plus de dix mille souches microbiennes sont référencées au Cirm, ne représentant qu’une partie des collections de l’Inra.

« Une collection de micro-organismes n’est pas un musée, elle n’est pas statique, il faut constamment l’enrichir, développer de nouvelles méthodes d’identification et de conservation », ajoute Chantal Bizet, responsable du Centre de ressources biologiques de l’Institut Pasteur (CRBIP). Au sein du centre de recherche parisien, le CRBIP regroupe quelque vingt mille souches de virus, de cyanobactéries, de champignons microscopiques et de bactéries, dont la plus vieille souche bactérienne conservée au monde, isolée en… 1892 !

Les partenaires du projet lanceront des appels d’offres afin de mettre leurs ressources, leurs équipements et leur expertise à la disposition de la communauté scientifique.

Par ses activités de mise en réseau et d’harmonisation, EMbaRC jettera également les bases du futur réseau international du Global Biological Resource Centre Network ( GBRCN), permettant à l’expertise et à la recherche européennes d’être au premier plan de la scène internationale.

• Sources : Inra et Institut Pasteur.