Un diagnostic moléculaire disponible pour l’ecthyma contagieux

La polymerase chain reaction (PCR) en temps réel est une méthode de diagnostic moléculaire susceptible d’être utilisée sur des prélèvements de lésions cutanées en vue de confirmer une suspicion d’ecthyma contagieux, chez les ruminants domestiques ou sauvages. Véronique Duquesne (Anses¹, laboratoire de Sophia-Antipolis, Alpes-Maritimes) confirme que cette technique est plus sensible que la microscopie électroni­que, qui nécessite une mise en culture du virus. Le diagnostic moléculaire ne requiert plus cette étape délicate souvent liée aux conditions de conservation du prélèvement. La méthode se révèle également plus sensible que la PCR conventionnelle. En effet, sur un échantillonnage (prélevé entre 2006 et 2009), la PCR en temps réel détecte 26 % de pré­lèvements positifs supplémentaires, dont la spécificité était confirmée par le séquençage des amplicons. Le gène codant pour une protéine majeure de l’enveloppe des parapoxvirus est la cible du diagnostic par PCR. La séquence de ce gène permet également d’évaluer la variabilité des souches. Notamment, l’analyse des prélèvements montre que les virus qui circulent en France se répartissent dans les groupes génétiques déjà décrits (souches NZ2 et Hoping). Cette méthode peut ainsi être envisagée pour le diagnostic et l’étude des parapoxvirus.

• 1 Agence nationale de sécurité sanitaire de l’alimentation.