Criblage des agents infectieux respiratoires chez la dinde

Afin de détecter simultanément plusieurs agents pathogènes respiratoires des volailles dans un même échantillon, un outil innovant de polymerase chain reaction quantitative en temps réel (RTqPCR) a été développé.

Des écouvillonnages trachéaux ont été réalisés dans des élevages de dindes de chair présentant des syndromes respiratoires depuis moins de 5 jours et n’ayant pas reçu d’antibiotiques depuis 1 semaine ou plus, en France et au Maroc, entre 2011 et 2013. Vingt-deux agents infectieux (virus, bactéries et champignons) ont été ciblés. Les amorces de PCR ont été appliquées à la RTqPCR nanofluidique Biomark^®, qui, en plus d’être sensible, reproductible et spécifique, peut cribler jusqu’à 96 échantillons en une seule réaction (ici, 88 échantillons d’élevages venant de France et 88 du Maroc). La présence d’Escherichia coli est systématique dans les échantillons, avec une grande majorité d’E. coli de génotype B2. Le criblage met également en évidence de fréquentes infections à métapneumovirus aviaire, Pasteurella multocida, Mycoplasma gallisepticum, M. synoviae et Riemerella anatipestifer, avec des profils de co-infections différents entre la France et le Maroc. Les paramyxovirus (PMV-1) souvent mis en évidence sont de type vaccinal. Ainsi, dans l’avenir, cet outil diagnostic peut être utilisé afin de détecter en une seule fois les agents responsables des infections respiratoires chez les volailles, dans un but de surveillance épidémiologique, et en l’adaptant au contexte et à l’émergence de nouveaux agents ou de leurs variants.
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